O IJM compreende os seguintes serviços:
- a)Direcção Administrativa e Financeira;
- b)Gabinete de Informática;
- c)Departamento Jurídico e de Apoio ao Associativismo;
- d)Departamento de Informação;
- e)Departamento de Programas e de Animação;
- f)Departamento de Apoio ao Jovem;
- g)Departamento de Coordenação dos Centros de Juventude.