Os departamentos do Governo Regional são os seguintes:
- a)Presidência do Governo Regional (PGR), que compreende o Gabinete do Secretário Regional Adjunto da Presidência para os Assuntos Parlamentares (SRAPAP) e o Gabinete do Secretário Regional Adjunto da Presidência para as Relações Externas (SRAPRE);
- b)Vice-Presidência do Governo, Emprego e Competitividade Empresarial (VPECE);
- c)Secretaria Regional da Solidariedade Social (SRSS);
- d)Secretaria Regional da Educação e Cultura (SREC);
- e)Secretaria Regional do Mar, Ciência e Tecnologia (SRMCT);
- f)Secretaria Regional dos Transportes e Obras Públicas (SRTOP);
- g)Secretaria Regional da Saúde (SRS);
- h)Secretaria Regional da Energia, Ambiente e Turismo (SREAT);
- i)Secretaria Regional da Agricultura e Florestas (SRAF).