O HFAR deve pautar a sua atividade pelos seguintes princípios de gestão:
- a)Gestão centralizada dos recursos, no respeito pelo cumprimento dos objetivos definidos pelo CEMGFA;
- b)Desenvolvimento da atividade de acordo com o previsto nos instrumentos de gestão previsional, designadamente plano de atividades, orçamento anual e outros;
- c)Desenvolvimento da atividade hospitalar, com base em indicadores de gestão e medidas de controlo interno, para apoio à decisão do diretor;
- d)Garantia da prestação de cuidados de saúde de qualidade aos utentes.