As unidades orgânicas flexíveis não integradas em unidades orgânicas nucleares são as seguintes:
- 1 -Divisão de Desenvolvimento Educativo e Gestão Escolar:
- 1.1 -Unidade de Planeamento e Gestão da Rede, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau;
- 1.2 -Unidade de Projetos Pedagógicos de Inovação Educativa, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau;
- 2 -Divisão de Desenvolvimento e Coesão Social:
- 2.1 -Unidade de Apoios Sociais e Família, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau;
- 2.2 -Unidade de Projetos Sociais, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau.
- 3 -Divisão de Cultura e Turismo:
- 3.1 -Unidade de Bibliotecas, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau;
- 3.2 -Unidade de Programas e Equipamentos, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau.
- 3.3 -Unidade de Turismo, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau.
- 3.4 -Unidade de Museus e Pólo Arqueológico, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau.
- 4 -Divisão de Desporto, Saúde e Juventude:
- 4.1 -Unidade de Infraestruturas Desportivas, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau;
- 4.2 -Unidade de Gestão de Programas e Projetos de Atividade Física e Saúde, que corresponde a uma unidade de direção intermédia de 3.º grau.