A ESTM dispõe dos seguintes órgãos:
- a)Um órgão uninominal de natureza executiva, o diretor;
- b)Um órgão colegial de natureza representativa, o conselho de representantes;
- c)Um órgão colegial de natureza técnico-científica, o conselho técnico-científico;
- d)Um órgão colegial de natureza pedagógica, o conselho pedagógico;
- e)Órgãos uninominais para coordenação de ciclos de estudos, o coordenador do ciclo de estudos;
- f)Órgãos uninominais para coordenação de departamentos, o coordenador de departamento;
- g)Um órgão colegial de natureza consultiva, o conselho consultivo.