O CIDIUM é chefiado por um docente ou investigador habilitado com o grau académico de doutor, detentor de experiência e currículo relevantes na área, nomeado pelo comandante do IUM, ouvido o conselho diretivo, com as seguintes competências:
- a)Promover e coordenar a articulação entre os centros e ID&I das UOA, tendo em vista o desenvolvimento das linhas de investigação nas áreas de interesse fundamentais da segurança e defesa nacional, potenciando as especificidades próprias das Forças Armadas e da GNR, em áreas de interesse do IUM;
- b)Coordenar o desenvolvimento das linhas de investigação nas áreas de interesse fundamentais da segurança e defesa nacional, potenciando as especificidades próprias de cada centro;
- c)Coordenar as relações de cooperação com outras instituições de ensino superior de investigação, designadamente com o órgão central de apoio no âmbito da segurança e defesa nacional responsável pelas áreas de armamento e infraestruturas;
- d)Participar na elaboração do plano estratégico de médio e longo prazo, no âmbito da ID&I.