A direcção do Departamento tem a seguinte estrutura:
- a)Director de departamento;
- b)A comissão executiva de departamento, que é composta pelo director de Departamento, pelos coordenadores das Áreas Científicas adstritas ao Departamento e por um secretário, docente do Departamento, nomeado pelo presidente;
- c)O conselho de departamento, que é composto por todos os docentes doutorados, de carreira, em regime de exclusividade ou em tempo integral, que integram o Departamento.