A estrutura interna hierarquizada do SIMAS compreende as seguintes unidades orgânicas nucleares:
- 1 -Departamento de Gestão de Clientes e Serviços Operacionais;
- 2 -Departamento de Sistemas de Informação;
- 3 -Departamento Administrativo e Financeiro;
- 4 -Departamento de Engenharia e Gestão de Infraestruturas;
- 5 -Departamento de Controlo de Infraestruturas e Gestão de Equipamentos;
- 6 -Gabinete Jurídico e de Auditoria.