Compete ao secretário do CEJ chefiar os serviços de secretaria, com observância do regulamento interno, e, em especial:
- a)Fiscalizar o funcionamento dos serviços, nomeadamente em matéria de faltas e licenças;
- b)Assegurar o secretariado do conselho de gestão, do conselho pedagógico, do conselho de disciplina e do conselho administrativo, lavrando as respectivas actas;
- c)Submeter a despacho os assuntos que exijam decisão superior;
- d)Elaborar ordens de execução permanente;
- e)Zelar pela guarda e conservação das instalações e valores afectos ao CEJ.