O CROAM é composto por áreas distintas, relacionadas entre si funcionalmente:
- a)Canil e Gatil:
- i)Canil e Gatil Interior - secção destinada, essencialmente, a alojar os canídeos e felinos abandonados, errantes ou vadios, capturados pelos serviços competentes da Câmara Municipal Matosinhos, ou por determinação das Autoridades Competentes, nos termos da legislação em vigor, composta por um conjunto de compartimentos independentes, destinados a alojar os animais passíveis de restituição aos respetivos donos ou detentores;
- ii)Canil e Gatil Exterior - secção destinada ao alojamento de animais que já se encontram disponíveis na bolsa de adoção do Município, onde é permitido o acesso ao público nas visitas de adoção, sempre acompanhadas por funcionários do CROAM.
- b)Zona de Restrição Sanitária - composta por celas semicirculares destinadas ao isolamento e quarentena de animais agressivos e ou suspeitos de doenças infeto contagiosas, nomeadamente a raiva, de acesso interdito ao pessoal estranho ao serviço do CROAM, exceto em situações autorizadas pelo Médico Veterinário Municipal;
- c)Zonas Comuns de Apoio - compostas por salas de armazenagem de rações, materiais e equipamentos para os animais, bem como de outros materiais e equipamentos de apoio ao CROAM, nomeadamente produtos de limpeza e de desinfeção;
- d)Gabinete Médico Veterinário - espaço destinado à armazenagem de fármacos, desinfetantes, outros produtos e materiais, bem como à execução das campanhas de profilaxia médico-sanitárias ou de outras ações determinadas pela Autoridade Sanitária Veterinária Nacional Competente, nomeadamente a vacinação antirrábica e a identificação eletrónica de caninos e felinos;
- e)Área Social e de Atendimento ao Público;
- f)Secretaria de apoio a todas as funções administrativas da competência do Serviço Médico Veterinário e Médico Veterinário Municipal;
- g)Vestiários e Instalações Sanitárias;
- h)Centro de refrigeração - câmara frigorífica;
- i)Zona de Higiene - Espaço destinado à higienização dos animais alojados no CROAM, nomeadamente à realização de banhos e tosquias;
- j)Sala de Cirurgia e Recobro/ Enfermaria;
- k)Zona de Recreio - Espaço composto por uma área cimentada e uma área ajardinada destinada ao exercício físico dos animais do CROAM.