A Secretaria-Geral dispõe dos seguintes serviços de natureza operacional:
- a)Direcção de Serviços de Contencioso (DSC), que compreende a Divisão de Contencioso Administrativo (DCA) e a Divisão de Consulta Jurídica (DCJ);
- b)Direcção de Serviços de Organização e Documentação (DSOD), que compreende a Divisão de Organização e Gestão (DOG) e a Divisão de Documentação, Informação e Relações Públicas (DDIRP);
- c)Direcção de Serviços de Aprovisionamento (DSAp), que compreende a Divisão de Estudos e Normalização (DEN) e a Divisão de Compras (DC);
- d)Direcção de Serviços de Assuntos Comunitários (DSAC), que compreende a Divisão de Acompanhamento do Funcionamento dos Órgãos e Instituições das Comunidades (DAFOIC) e a Divisão de Coordenação e Consulta para os Assuntos Comunitários (DCCAC);
- e)Direcção de Serviços Administrativos (DSA).