O Secretariado compreende os seguintes serviços:
- a)Departamento dos Assuntos Jurídicos;
- b)Departamento dos Mercados Agrícolas;
- c)Departamento das Estruturas Agrícolas e dos Assuntos Económicos e Financeiros;
- d)Departamento de Política Comercial e Relações Externas;
- e)Centro de Organização, Documentação e Informação Pública;
- f)Repartição Administrativa.