No MOPTC funcionam:
- a)A Comissão de Planeamento de Emergência dos Transportes Terrestres (CPETT);
- b)A Comissão de Planeamento de Emergência do Transporte Aéreo (CPETA);
- c)A Comissão de Planeamento de Emergência das Comunicações (CPEC);
- d)O Gabinete de Prevenção e Investigação de Acidentes com Aeronaves (GPIAA);
- e)A Comissão Técnica do Registo Internacional de Navios da Madeira (MAR);
- f)A Autoridade de Segurança da Ponte de 25 de Abril.