De entre outros que poderão ser criados, existem na ESTeSL os seguintes departamentos:
- a)Departamento das Ciências Naturais e Exactas;
- b)Departamento das Ciências da Saúde;
- c)Departamento das Ciências Sociais e Humanas;
- d)Departamento das Ciências e Tecnologias Laboratoriais e Intervenção Comunitária;
- e)Departamento das Ciências e Tecnologias das Radiações e Biosinais da Saúde;
- f)Departamento das Ciências e Tecnologias de Avaliação Funcional e Intervenção Terapêutica.