O funcionamento da ESESJC está sujeito aos seguintes princípios gerais:
- a)Independência em relação a qualquer instituição de natureza política, social, económica ou religiosa;
- b)Autonomia científica, pedagógica e cultural;
- c)Colaboração e intercâmbio com instítuições congéneres, nacionais e estrangeiras;
- d)Participação do corpo docente e do corpo discente.