Os órgãos do ISPA são os seguintes:
- a)Reitor;
- b)Assembleia de representantes;
- c)Conselho científico;
- d)Conselho pedagógico;
- e)Conselho de gestão;
- f)Conselho consultivo;
- g)Conselho de acção social;
- h)Conselho cultural;
- i)Conselho disciplinar;
- j)Conselho de ética.