São órgãos departamentais permanentes o diretor do departamento e a comissão científico-pedagógica.
- 1 -O diretor do departamento é um órgão uninominal nomeado pela direção da entidade instituidora, sob proposta do reitor, para um mandato de um ano escolar, renovável.
- 2 -A comissão científico-pedagógica é um órgão colegial constituído pelo diretor do departamento, pelos coordenadores dos cursos e por todos os docentes com o grau de doutor que lecionam nesses mesmos cursos.
- 3 -Os docentes de cada departamento podem organizar-se em secções, de acordo com o respetivo regulamento, por forma a possibilitarem a transversalidade pedagógica de uma dada área científica dentro do departamento ou entre departamentos.